文件名称:
Gene_Signature_Discovery:通过机器学习发现基因签名-源码
开发工具:
文件大小: 21mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明:基因签名发现
描述:
基于乳腺癌亚型患者的microRNA,mRNA定量数据和其他临床数据,我们希望通过机器学习建立模型以预测5年生存率和肿瘤分期。 如果不能正确预测这些标签,我们希望通过聚类进行数据挖掘,以找出是否可以将数据分类为其他子类以及区分这些子类的基因。 此外,我们想找出那些基因参与的生物学途径,并对微RNA-mRNA对的特征做出假设。
- Writen report can be found here: (https://github.com/timothyfisherphd/Gene_Signature_Discovery/blob/main/Gene_Signature_Discovery.pdf)
用法
打开终端或命令窗口以执行以下代码:./run.sh
使用基因列表的输出,然后通过/ Pathway_Analysis运行基因名称。 打开Python3并在./GO_
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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