文件名称:
automate_16s:该项目的目标是使16s rRNA分析自动化,使其更易于访问-源码
开发工具:
文件大小: 37kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-10
详细说明:自动化16秒
该项目的目标是致力于使16s rRNA分析过程自动化,从而可能使该过程更易于访问。
先决条件
基于Linux的系统
qiime 2
python3
安装
$ git clone https://github.com/lorentzben/automate_16s.git
克隆后,将创建一个名为automate_16s的文件夹。 里面将是:
自述文件
setup.py
automate_16.py
automate_single.sh
automate_slurm_submission.sh
报告
Example_MANIFEST.tsv
Example_METADATA.tsv
必须使用相关信息编辑automate_single.sh和/或automate_slurm_submission.sh,包括清单和元数据的文件名,用于通知已完成作业的电子邮件以及fa
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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