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一种识别植物替代剪接位点的新颖计算方法
选择性剪接(AS)通过从高级真核生物中的单个基因生成多个转录异构体来增加蛋白质多样性。 多达48%的植物基因表现出可变剪接,已被证明与某些重要的植物功能有关,例如胁迫响应。 提出了一种结合位置权重矩阵(PWM)和分集增量(ID)的混合特征提取方法,分别表示拼接点附近的基本保守水平(BCL)和两个数据集的相似度。 使用提取的特征,将支持向量机(SVM)应用于对替代和本构剪接位点进行分类。 通过提出的算法,正确分类了80.8%的供体位点和85.4%的受体位点。 预期该新颖的计算方法有望用于鉴定植物中
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:563200
提供者:
weixin_38660108