注册会员 | 设为首页 | 加入收藏夹
您好，欢迎光临本网站！[请登录] ！[注册会员]！  

搜索资源列表

  1. 人类参考基因组

  2. 人类参考基因组 一、人类参考基因组的来源 1、人类基因组计划 1）2001年草图，绘制人类基因组图谱 2、数据库的名称 1）UCSC：hg19，hg38 2）NCBI：GRCH19，GRCH38 二、如何下载参考基因组 在 linux 中下载参考序列数据库： 1. hg38：wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg38.fa.gz 2. hg19：wget http://hgdownload.cse.ucsc.e

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-12-21
    • 文件大小：87040
    • 提供者：weixin_38553837

  1. Brkljacic_etal-源码

  2. Brkljacic_TE_paper_scr ipts 该存储库包含用于Brkljacic等人进行分析的脚本，“质粒存储库中转座因子的频率，组成和迁移性” 脚本名称包括指示运行顺序的数字。 分析是在实现PBS的超级计算机系统（俄亥俄州超级计算机中心）上进行的，因此脚本顶部的指令特定于PBS系统。 脚本假定目录包含data /和scr ipts /。 data /包含gen10和gen70 .fastq.gz文件scr ipts /包含以下描述的脚本。 每个命令都可以直接在此脚本/目录中运行

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-17
    • 文件大小：14336
    • 提供者：weixin_42171132

  1. 汤尔-UL87LTF-源码

  2. 汤尔-UL87LTF 这是现有和新的HCMV Towne-UL87LTF数据集的精选集合，可在查看。 用法： First go to the UCSC Genome Browser. Then, navigate to My Data > Track Hubs. Select the My Hubs tab. Finally, paste https://raw.githubusercontent.com/meierjl/Towne-UL87LTF/master/hub.txt int

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-28
    • 文件大小：28311552
    • 提供者：weixin_42175035

  1. VEuPathDB本体-源码

  2. VEuPathDB本体 VEuPathDB本体是一种应用程序本体，其开发目的是编码我们对真核病原体，宿主和载体基因组学资源（VEuPathDB; ）开发和维护的公共资源中有关数据的理解。 VEuPathDB本体在EuPathDB与VectorBase合并之前曾被称为EuPathDB本体，该本体是基于生物医学研究本体（OBI）并根据需要覆盖其他OBO本体（例如PATO，OGMS，DO等）而构建的。 当前，VEuPath本体主要用于支持VEuPathDB站点。 VEuPathDB本体ID不特定于V

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-27
    • 文件大小：28311552
    • 提供者：weixin_42155721

  1. AMP指令-源码

  2. ALE重测序QC和突变发现管线 警告：仅在原始读取文件的副本上运行这些脚本。 保留所有原始读取文件的备份。 系统要求任何计算机：至少100GB存储空间。 背景 突变流水线完成了Pabinger等人（美国） 等2014年。“下一代基因组测序数据变异分析工具的调查。” 生物信息学简报15（2）：256–78。 工作流程 准备数据 生成新的元数据： : 确保元数据中的所有文件名与您读取的文件和参考文件完全匹配。 将所有读取的文件，参考文件和元数据文件放在同一文件夹/目录中。保存此目录的绝对路

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42114645

  1. MHC-Imputation-Accuracy：有关评估MHC地区基因型插补准确性的硕士项目-源码

  2. MHC输入准确度 问候！！ 很高兴有你在这里！ 介绍 传统上，全基因组关联研究（GWAS）使用基因分型阵列对大型个体（通常是病例和对照）进行基因分型，以确定哪些SNP在病例中明显超标，以鉴定与疾病的关联。 基因分型阵列比测序便宜，但仅“测量”标签或整个基因组中选定的SNP（最多250万个SNP）。 为了增加每个个体可用的SNP数量，可以使用相关群体的全基因组序列数据参考面板从阵列上的SNP中估算SNP。 这可以归因于SNP的非随机继承或连锁不平衡（LD）。可以采用几种方法进行插补，还有几种不同的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-10
    • 文件大小：19456
    • 提供者：weixin_42102401

  1. 12SfishClassifier:该存储库包含12S线粒体基因参考集，可与RDP分类器一起使用以对鱼类中的12S元条形码序列进行分类-源码

  2. 介绍 该资料库包含经过培训的参考集，可与核糖体数据库项目分类器（Wang等，2007）一起使用，以分类分配鱼类12S线粒体基因序列。 可以从下载最新版本。 笔记 该分类器适用于将鱼类12S线粒体基因序列分类为属。 从鱼类的线粒体基因组数据库（MitoFish）获得参考序列，为等人，2018），并检索了12S基因区域的序列。 分类法基于NCBI分类法数据库。 如何引用 如果您在出版物中使用此12S鱼参考集，请在“方法”部分链接到此页面。 还请引用MitoFish数据库，其中提供了线粒体基因组序列

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-04-01
    • 文件大小：3072
    • 提供者：weixin_42144707