本算法是基于遗传算法实现分子团簇的最优结构，对每代染色体用共轭梯度算法优化，通过选择、杂交、变异，有限次迭代后找到一个分子团簇的最优结构。本算法使用水分子作为例子的。

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透明导电薄膜被广泛应用于平板显示，太阳能电池等发光行业。透明导电薄膜厚度的减少将导电薄膜的用途大为拓展，目前该薄膜的制备仍然是研究热点。采用激光分子束外延（LMBE）镀膜系统在1.0×10-5 Pa的高真空下制备了不同厚度、不同氧压下的ZnO单层膜以及ZnO/Au/ZnO三明治结构薄膜，并进行了光谱及电阻率的测试，运用控制变量法得到ZnO和Au的最优膜层厚度。制备出通透性好（可见光透射率80%以上）、电阻率低(6.89×10-4 Ω·cm)厚度均匀的透明导电薄膜。