当今复杂的FPGA含有众多用于实现各种电路与系统的功能块，诸如逻辑阵列、存储器、DSP 模块、处理器、用于时序生成的锁相环 （PLL） 和延迟锁定环 （DLL）、标准I/O、高速数字收发器以及并行接口（PCI、DDR 等）。这些不同的功能块通常由多个时钟驱动，FPGA 一般会综合采用外部振荡器以及内部PLL 与DLL来生成时钟。