历史上，许多国家已禁止使用抗生素生长促进剂来控制病原体并提高人类食用动物的生长速度。 已提出益生菌作为控制病原细菌的替代方法。 通常用于监测益生菌对病原体影响的传统培养方法具有明显的局限性，例如缺乏对挑食性和不可培养细菌的检测敏感性，既费时又费钱。 在这里，我们测试了下一代焦磷酸测序技术，这是一种流线型经济方法，用于监测益生菌暴露于多种微生物挑战和垫料条件下对家禽（Gallus gallus domesticus）微生物群落的影响。 孵化7天后，在孵化后第39天再次重复，在饲料中添加或不添加益生