功能性近红外技术是一种新型无损检测人脑功能性活动的探测技术，该技术监测到的脑功能信号易受到生理活动和人的相对运动的干扰，分别称为生理干扰和运动伪迹，这些干扰的存在严重影响信号质量，因此需要开发消除生理干扰和运动伪迹的信号处理方法。介绍了目前功能性近红外信号的主要干扰源、相应的生理干扰与运动伪迹的去除方法，分析了当前功能性近红外技术存在的问题和可能的发展方向,并重点讨论了功能性核磁共振技术与功能性近红外技术的优劣。最后总结了功能性近红外数据处理方面的发展前景。