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搜索资源 - 在linux中用同一个版本的R同时安装Seurat2和Seurat3的教程
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在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3的教程
主要介绍了在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3的教程,本文给大家介绍的非常详细,具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
所属分类:
其它
发布日期:2020-09-14
文件大小:62464
提供者:
weixin_38732454
在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3的教程
Seurat 作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道。Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法,包括filtering,tSNE,UMAP降维及画图等。还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应。然而Seurat 2和Seurat 3的矫正方法完全不一样,得到的结果也不一致。 Seurat 2是基于CCA (典型相关性)的,可以矫正肿瘤,外周血及癌旁组织间由于实验带来的批次效应,也能很好的矫正用不同的单细胞实验平台进行试验带来的批次效应。虽然速度慢
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-20
文件大小:65536
提供者:
weixin_38674763