具有星上数字处理能力的卫星通信系统因受空间辐射环境影响，容易发生单粒子翻转而严重影响系统可靠性。传统三模冗余方案开销巨大，因此，研发低开销、高可靠性的容错方法已经成为星上数字处理技术的重要方向。本文针对常用的FFT模块，提出了一种基于余数校验的单采样判决容错方法。传统基于余数校验的FFT方案因存在大量蝶形运算，而需将旋转因子扩大一定倍数以保证计算精确，导致复杂度大大增加。本文在FFT的中间一级将数据进行截断，并在截断前增加单采样判决模块确保正确的数据输出，同时针对上述过程中增加的取模操作提出了一