针对航空器中SRAM型FPGA的单粒子翻转效应故障注入研究越来越重要的趋势，提出基于分区测试的翻转故障注入方法。根据FPGA配置帧的结构特点，对其进行分区测试，分析配置存储器中的敏感位，找到FPGA配置帧中最为敏感的区域。基于动态可重构技术设计了故障注入测试系统，并进行了试验验证。测试结果表明，该方法具有较好的准确率，且能够大大提高翻转故障注入测试的测试效率。