光学相干层析（OCT）技术在活体成像应用中的无损、高速、超高分辨率特性使其在生物医学领域有着广阔的发展空间。通常情况下, OCT系统的数据采集量巨大, 图像重建中包含的快速傅里叶变换（FFT）需要大量的计算时间, 中央处理器(CPU)串行数据处理模式难以满足实时成像的需求。针对这一问题, 将统一计算设备架构(CUDA)并行编程技术应用到皮肤组织成像的谱域相干光断层成像(SD-OCT)系统数据处理过程中, 并在图形处理器(GPU)上予以实现。详述了系统算法并行化拆分以及对系统采集到的数据进行并行化