序列比较是生物信息学的基础之一，可用于研究序列之间的进化关系。 在这项研究中，基于氨基酸的疏水性尺度，提出了蛋白质序列的二维光谱状图形表示。 采用4个子序列的振幅频率来表征类似频谱的图，并使用17D矢量作为蛋白质序列的描述符。 执行兼容性测试的chi（2）值。 在所有蛋白质序列上都展示了一种新的相似性分析方法，该序列由20种不同物种的线粒体基因组编码。 最后，与ClustalW方法的比较显示了我们方法的实用性。