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  1. 基于最大似然结合p-ECR和邻居加入的进化树搜索方法中的拓扑变换

  2. 背景:使用最大似然原理推断进化树是NP-hard。 因此,所有实际方法都依赖于启发式方法。 启发式中经常使用的拓扑转换是最近邻居交换(NNI),子树修剪和移植(SPR)和树二等分和重新连接(TBR)。 但是,由于从任何给定树到一步之遥的树都不多,因此这些拓扑转换通常容易陷入局部最优。 另一个更详尽的拓扑转换是p边缘收缩和细化(pECR)。 然而,由于其高计算复杂性,在实践中很少使用p-ECR。 结果:为了使p-ECR的移动效率更高,本文提出了一种名为p-ECRNJ的新方法。 p-ECRNJ的主要
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-22
    • 文件大小:362496
    • 提供者:weixin_38535364