以医院电子病历为核心的临床数据记录了病人的疾病、诊断和治疗信息。挖掘此类数据，可以辅助医生进行临床科研与临床诊疗。首先提出了临床大数据挖掘过程中碰到的各项难题，总结了临床医疗大数据挖掘的核心流程，流程包括以临床数据集成、基于知识图谱的临床专病库的构建过程、电子病历数据质量的评估方法以及以临床疗效分析与疾病预测为核心的临床医疗大数据应用等任务，进而对流程中的每个任务提出了解决方案，给出了实验结果。最后，展望了未来临床电子病历挖掘应用和技术的发展。