在多频脉冲信号检测与估计的算法中，通过采用三级CIC滤波器实现对多个频率脉冲信号的快速检测，采用传统的能量检测和madζ法联合检测的方法实现了信号频率等参数的准确估计。实验验证该算法满足在复杂背景噪声下可靠地检测多频水声脉冲信号，数据处理算法的有效性得到了验证。