针对甚高频（VHF）云闪时差法雷电定位同源脉冲匹配难点，提出了用FPGA实现相关性判断的同源脉冲算法设计思路。为提升系统性能、适应云闪甚高频信号的处理需求，采用了改进的算法并用实测数据在MATLAB、FPGA上对算法进行验证，设计完成了云闪波形同源脉冲匹配算法在FPGA上的实现。系统通过了Modelsim的仿真验证并在DE2平台上完成了硬件测试。设计共消耗了3 499个逻辑单元，最高处理速度可达98.07 MHz，满足了实际应用的要求。