将长读映射到大型参考数据库 这是FER（ ）上的生物信息学课程的一个项目。 描述实现算法的论文可以在 找到，其C ++实现。 随着作者对算法的改进，C ++实现似乎与本文的描述有所不同。 安装 该程序的依赖项全部捆绑在./pom.xml ，因此将自动下载。 您只需要在计算机上安装Maven。 从项目根目录运行mvn package应该足以将程序安装在./target下。 运行程序 该程序需要两个参数，即FASTA文件格式的引用和查询（提供的FASTA文件不应包含任何注释）。 您可以通过发出