1. 分子动力学模拟概论 1.1 分子动力学模拟的发展 1.2 分子动力学模拟的基本原理 1.3 分子动力学模拟相关软件 2. 分子动力学入门 2.1 基本设置 2.2 生成蛋白质结构文件（PSF） 2.3 蛋白质的溶质化 2.4 球状水体中泛素（Ubiquitin）的分子动力学模拟 2.5 立方水体中泛素（Ubiquitin）的分子动力学模拟 2.6 简单的结果分析 3. 分析方法 3.1 平衡态分子动力学模拟分析 3.1.1 每个残基的RMSD值 3.1.2 麦克斯韦-波尔兹曼（Maxwe

我们使用固定整数维中定义的隐式规范不变正则化/重新归一化方法研究Lorentz和Dirac代数，包括反对称ϵ张量和γ5矩阵。 它们包括约束微分，隐式和四维重新规范化。 我们发现这些固定维方法面临着与不同版本的维正则化相同的困难。 我们在这些方法中提出了一个一致的程序，类似于通过降维进行正则化的一致版本。