滤波是干涉图像处理中的关键问题之一。为解决加窗傅里叶滤波在干涉条纹处理中运行时间长的问题，采用了快速傅里叶变换算法用以减少计算时间。通过加窗傅里叶变换，克服了傅里叶变换在干涉图相位局部信息不能提取的缺点，提出了一种快速加窗傅里叶滤波方法，实现了干涉条纹的快速滤波。在保证滤波效果的同时，缩短了计算时间，大大提高了干涉条纹处理速度，从根本上解决了加窗傅里叶滤波耗时长的问题，使得加窗傅里叶滤波方法应用于散斑在线检测成为了可能。实验验证了本方法的快速性、有效性和可靠性。