现有的抗生素发酵系统大多不具备自动诊断异常的功能，为提高抗生素发酵的自动化水平，提出了一种应用于抗生素发酵的专家诊断系统。该系统结合抗生素发酵工艺特点，利用关系型数据库技术设计出一种产生式树形结构的知识库，并结合Snort规则库中的三维链表结构对知识库进行优化，采用高效的混合推导规则控制策略，最终设计出应用于抗生素发酵的专家诊断系统。由实验结果可知，系统实现了对抗生素发酵过程中异常状况的预测诊断和分析提示，对提高抗生素发酵率的生产目标具有一定的应用价值。