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昆虫:信息序列分类树-源码
信息序列分类树 insect是一种R包,用于通过分类识别由DNA元条形码分析产生的扩增子序列变体。 软件包中实现的学习和分类算法基于完整的概率模型(轮廓隐式马尔可夫模型),并提供了高度准确的分类ID,尽管计算成本较高。 该软件包还包含用于从NCBI搜索和下载参考序列和分类信息的功能,用于序列修整的“虚拟PCR”工具,用于清除错误标记的参考序列的功能以及其他一些工具。 insect被设计为与管线或其他产生一系列扩增子序列变体(ASV)的去噪工具结合使用。 尽管未过滤的序列也可以进行高精度处理,
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:138240
提供者:
weixin_42120283