NetKey网络安全身份认证系统以Windows操作系统为平台，采用C/S结构，利用NetKey的硬件信息和存储在NetKey中的用户认证信息，来完成用户登陆时的身份认证。NetKey系统核心提供NetKey系统的核心功能，包括身份认证、锁定电脑、文件加密、日志处理、登陆网络、系统界面、错误处理、网络控制、数字证书接口和系统保护等等，它不直接面对用户，而是由NetKey系统的用户接口调用，来完成系统的各项复杂功能。