CUTRUN_Nextflow
使用Nextflow构建的CUT&RUN-seq分析管道。
短读修整和对齐过程基于以下论文:
MACS2和可用于调用峰值。
流程图
用法
$nextflow run khigashi1987/CUTRUN_Nextflow -r main --help
N E X T F L O W ~ version 20.10.0
Launching ` ./main.nf ` [nice_pasteur] - revision: 48ae873b6f
Usa
我就废话不多说了,直接上代码吧:
from pandas import Series,DataFrame
import pandas as pd
import numpy as np
from numpy import nan as NA
from matplotlib import pyplot as plt
ages = [20,22,25,27,21,23,37,31,61,45,41,32]
#将所有的ages进行分组
bins = [18,25,35,60,100]
#使用panda