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VPTM数据库 VPTMdb是病毒翻译后修饰位点（PTM）的综合数据库。 我们已经收集了1240个PTM站点，这些站点将818个实验确认的PTM站点整合到从150种出版物中手动提取的43种病毒中，以及从UniProtKB / Swiss-Prot中提取的422种PTM中。 VPTMpre是一种新颖的基于特征的预测器，已集成到VPTMdb中，供用户预测感兴趣的磷酸化位点。 作者摘要 翻译后修饰（PTM）在病毒蛋白的调控中起着重要作用。 但是，由于数据集的限制，没有对病毒蛋白PTMs特性进行详细研究

波罗的海：以反义词命名的自适应轻量级树导入代码 最初开发波罗的海以自定义方式从衍生的分子系统发育中提取各种统计数据。 我的使用波罗的海代码的早期版本来研究根据基因组背景如何构建人类乙型流感病毒片段多样性。 从那以后，我将代码的各个部分分为三部分： 波罗的海 是树解析器本身。 它使用三个主要类-节点，叶和树来导入，操纵和绘制具有多种注释的BEAST树。 节点和叶类引用了系统发育中常见的参数集-指定分支的字符串索引（树中的唯一标识符），长度，高度，时间位置（absoluteTime），X和Y坐标，对