针对基于相位调制的结构光用于深度获取时，投影系统、图像采集系统光瞳中心不等高而引入测量误差，提出一种测量系统校准方法。该方法以N帧正交光栅像与一立方体物体为辅助，根据光场中立方体边缘的阴影位置及其表面光栅栅线变形情况实现系统的粗校准；通过计算立方体深度在光场水平方向引起的相位变化量，指导系统的精校准。该方法可为基于结构光的深度获取装置校准提供理论指导，为非经验装调工作者提供技术支持，实验数据论证了该方法的有效性。