MMseqs2:超快速和灵敏的序列搜索和聚类套件
MMseqs2(多对多序列搜索)是一个软件套件,用于搜索和聚类巨大的蛋白质和核苷酸序列集。 MMseqs2是开放源GPL许可的软件,以C ++实现,适用于Linux,MacOS和Windows(作为Beta版本,通过cygwin)。 该软件旨在在多个内核和服务器上运行,并具有很好的可伸缩性。 MMseqs2的运行速度比BLAST快10000倍。 它以其速度的100倍达到了几乎相同的灵敏度。 它可以以与PSI-BLAST相同的灵敏度以超过其400倍