转录组测序分析流程

曲目 单细胞免疫分析的工具包 介绍 单细胞测序是免疫学和肿瘤学领域的一项新兴技术，它使研究人员能够将RNA定量和其他方式耦合在一起，例如在单个细胞水平上对免疫细胞受体进行谱分析。 已经创建了许多工作流程和软件包来处理和分析单细胞转录组数据。 这些程序包使用户可以利用在基于单细胞的实验中生成的数据的广阔维度，并将数据提炼成新颖的见解。 与转录组领域不同，缺少允许单细胞免疫受体分析的软件选项。 为了使用户能够轻松地将RNA和免疫分布图结合起来，scRepertoire能够处理从10倍基因组学Chro

寻求RNA 用于分析RNA序列数据的开源，可复制和可扩展的解决方案。 目录 2.1 2.22.32.4 3.13.2 3.3 1.简介 RNA测序（ RNA-seq ）具有广泛的应用。 这种流行的转录组分析技术可用于定量基因和同工型表达，检测其他剪接事件，预测基因融合，调用变体等等。 RNA-seek是一个全面的开放源代码RNA-seq管道，它依赖于诸如和来保持最高水平的可重复性。 该管道包括由精心策划的一系列数据处理和质量控制步骤， 是一种灵活且可扩展的工作流管理系统，用于将作业提交给集群