生物套件
BioSuite是使用常见细菌基因组学工具的MATLAB函数的集合。
描述
严格的生物信息学管道通常需要集成多个工具,每个工具都依赖于具有复杂依赖性的不同语言。 对于具有一种(或更少)编程语言经验的学生和/或没有计算背景的更高级的科学家而言,这些障碍极具挑战性。 BioSuite是许多使用最广泛的细菌基因组学工具的汇编,包括全基因组比对,从头组装,SNP调用和功能注释/分析。 MATLAB包装器为后端源代码提供了一个简单的接口,并利用独立的conda环境来避免依赖冲突。 更高级的用户可