3DFI管道预测蛋白质的3D结构，然后在3D空间中搜索结构同源性。 使用来自程序包的GESAMT（大分子靶的一般有效结构比对）的本地副本数据库搜索PDB格式预测的结构。 还可以针对一组预测结构搜索已知的PDB结构，以识别预测数据集中潜在的结构同源物。 目录 介绍 关于功能推论 使用计算方法推断蛋白质的功能通常涉及基于序列或结构进行某种同源性搜索。 在基于序列的搜索中，使用诸如 ， ， 或工具针对已知的蛋白质或基序查询核苷酸或氨基酸序列，但如果所研究的蛋白质差异很大，这些搜索可能会失败。 在基于