从生物医学文献中自动提取蛋白质-蛋白质相互作用信息可以帮助建立蛋白质关系网络，预测蛋白质功能并设计新药。 本文介绍了用于生物医学文献的蛋白质-蛋白质相互作用提取系统BioPPIExtractor。 该系统将条件随机场模型应用于生物医学文本中的蛋白质名称，然后使用链接语法分析器来识别句子中的句法角色，最后通过分析句法角色的匹配内容及其在语言上的重要组合，提取出完整的相互作用。 使用其他两种最先进的提取系统进行的实验评估表明，BioPPlExtractor系统具有更好的性能。