COVID随机拟合 代码和数据存储库，用于拟合美国SARS-CoV-2传输的州级随机模型。 概述 请访问网站链接以获取有关模型的说明，拟合过程，结果以及更多详细信息。 简而言之，该存储库包含重现我们的工作所需的数据和代码，该工作适合SEIR模型，以适用于美国50个州的SARS-CoV-2病例和死亡的每日报告。 我们的工作严重依赖R包盛况。 如何产生结果 与生成结果相关的三个主要例程： 下载数据并为每个状态创建pomp模型对象 拟合模型使用盛况::数据mif2功能通过迭代滤波来执行最大似然估计。