计算基因组学软件 计算基因组学Java项目，其中包括：成对序列比对，系统发生和多序列比对。 成对序列比对 计算两个序列（DNA，RNA或蛋白质）的成对序列比对的程序。 •输入（用于输入参数的简单GUI）： 两个序列的文本字段（允许的字符az和AZ） 带有替换矩阵值的字段。例如：匹配2不匹配-1 indel -1.5间隙0•单选按钮以选择对齐算法：o整体对齐o末端空间自由对齐o局部对齐o仿射间隙罚分模型对齐•按钮以启动算法。 •输出（带有对齐输出的GUI窗口）o成对对齐，显示所有匹配项，子项和