DNA计算基本原理是利用DNA分子的双螺旋结构和WC碱基互补配对原则进行信息编码,将实际问题映射成DNA分子链.借助生物酶的作用进行可行性生物学操作,生成全部数据池,再遵循特定的规则将抽象问题的数据运算并行地映射成DNA分子链的可控的生化反应过程,最后,利用分子生技术(如亲和层析、聚合链反应PCR克隆、磁珠分离、诱变、电泳、分子纯化等),检测出可行的运算结果。