运行HiC runHiC是用于Hi-C数据处理的易于使用的命令行工具。 由于0.8.1版本，runHiC可以直接使用上通过酶名字为马数据。 从0.8.0版开始，runHiC将其默认数据容器/格式从HDF5更改为 and 。 （请参阅） 设计概念 runHiC旨在处理从原始测序读数（.sra，.fastq，.fastq.gz）到校正后的联系矩阵的Hi-C数据。 它当前包含5个子命令： 映射 将原始的双末端测序数据映射到提供的基因组。 支持bwa和minimap2。 过滤 执行读取级和