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生物信息学功能数据库KEGG数据库介绍
生物信息学代谢通路数据库,用于生物信息学功能分析,有助于了解生物代谢途径。
所属分类:
其它
发布日期:2011-05-17
文件大小:2097152
提供者:
luhuiping
KEGG数据库简介
对KEGG数据库的使用等进行介绍,了解KEGG数据库。
所属分类:
数据库
发布日期:2012-08-09
文件大小:2097152
提供者:
wskwxf
KEGG有关内容
KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;
所属分类:
其它
发布日期:2012-09-10
文件大小:910336
提供者:
muhuangzero
KEGG中文使用教程
介绍KEGG网站的一些使用,操作步骤跟选项说明,
所属分类:
专业指导
发布日期:2012-12-03
文件大小:1048576
提供者:
arenewu
KEGG使用教程
KEGG数据库是一个关于通路的数据库。本教程为学习KEGG提供了一个很好的指导
所属分类:
讲义
发布日期:2014-09-11
文件大小:1048576
提供者:
jialovelyjia
KEGG数据库的使用方法与介绍
KEGG数据库使用方法,适合用到生物信息学分析的同学们
所属分类:
医疗
发布日期:2014-10-22
文件大小:1048576
提供者:
xuchuchu_0814
KEGG数据库中文教程
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是由日本京都大学和东京大学联合开发 的数据库,可以用来查询代谢途径,酶(或编码酶的基因),产物等,也可以通过 BLAST 比对 查询未知序列的代谢途径信息。KEGG 主要通过 Web 界面进行访问,同样也可以通过本地运行 的 Perl 或 java 程序进行访问,使用很方便。 本教程将结合实例来介绍 KEGG 数据库的使用方法,希望能您能通过本教程了解 KEGG 数 据库的基 本使用 方法。
所属分类:
专业指导
发布日期:2015-08-22
文件大小:1048576
提供者:
johnlcd
KEGG数据库中文教程
所属分类:
其它
发布日期:2017-03-05
文件大小:1048576
提供者:
qq_22147875
KEGG for integration and interpretation of large-scale molecular data sets
KEGG for integration and interpretation of large-scale molecular data sets论文
所属分类:
互联网
发布日期:2017-03-09
文件大小:5242880
提供者:
qq_17161513
获取KEGG数据库中的癌症Pathway的基因集
如何利用在线数据库检索各种癌症Pathway相关的已知的信息基因
所属分类:
医疗
发布日期:2017-12-12
文件大小:1048576
提供者:
csanmum
matlab开发-keggparserparsingandeditingkeggpathwaymapsinmatlab
matlab开发-keggparserparsingandeditingkeggpathwaymapsinmatlab。基于matlab图形的kegg路径分析、编辑、可视化和分析工具
所属分类:
其它
发布日期:2019-08-27
文件大小:2097152
提供者:
weixin_38744207
KEGG-GO注释分析代码.R
转录组分析差异表达基因注释时,用R语言的biocondcouter分析,根据代码,搜索需要分析的物种,就可出来结果
所属分类:
互联网
发布日期:2020-05-10
文件大小:3072
提供者:
weixin_43125787
解析microRNAs对KEGG信号通路的调控
解析microRNAs对KEGG信号通路的调控,朱文良,杜智敏,目的 解析microRNAs对KEGG信号通路的调控。方法 采用miTALOS在线miRNA信号通路调控分析工具,对搜集文献的人体表达miRNAs进行KEGG信号通路富�
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-13
文件大小:306176
提供者:
weixin_38590790
mtdtag:代谢物数据汇总器-源码
代谢物数据汇总器 乔治·马龙先生 3月23日,2021 概述 该存储库包含用于将代谢物数据聚集到一个表或一组表中的方法的组件,通常将其定义为JSON。 构造 表中的初始建设需要使用含有从PathBank数据的JSON的(排列格式的并且其描述),并从输出操作/list/compound 。 添加 该表中的其他数据是从原始PathBank JSON收集的,因此可以将更多标识符归因于每个唯一的SMILES代码。 当前,除了KEGG ID外,每个SMILES代码现在还具有一个CAS注册表号,ChEBI
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-25
文件大小:13312
提供者:
weixin_42099936
RHermes-源码
爱马仕 RHermes是一种广泛的靶向代谢组学软件,用于分析LC-MS和LC-MS / MS数据,以鉴定生物或环境样品中的化合物。 RHermes工作流程可与Orbitrap和q-TOF仪器数据一起使用,并带有易于使用的GUI,它将指导您完成每一步。 在查看文档 系统要求 推荐的系统要求是: 至少4核处理器 8-16 GB RAM或更多 Internet连接以执行KEGG查询 安装 您可以使用以下方法从下载开发版本: if ( ! requireNamespace( " devtools
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42133415
NovoBridge-源码
NovoBridge 这是NovoBridge管道的存储库,如以下内容所述: Hugo BC Kleikamp,Mario Pronk,Claudia Tugui,Leonor Guedes da Silva,Ben Abbas,Yue Mei Lin,Mark CM van Loosdrecht和Martin Pabst ) 可从: 什么是Novobridge? Novobridge是用于快速处理以及从头蛋白质组学数据的集成注释和可视化的自动化管道。 基本用途 它是如何工作的? 当前
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-15
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42152298
GeneDMRs:GeneDMRs是一种R软件包,用于检测基于基因,基因体,CpG岛以及与CpG岛特征相互作用的基因体的差异甲基化区域-源码
基因DMR 基于基因的差异甲基化区域分析 入门 描述 GeneDMRs是一个R软件包,用于检测基于基因(DMG),基因体(DMP,DME,DMI),CpG岛和与CpG岛特征(例如DMG / DMP / DME / DMI_CpG岛和DMG / DMP / DME / DMI_CpG岛岸)。 依存关系 使用注释数据集进行丰富,例如鼠标的“ org.Mm.eg.db” if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) instal
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:69206016
提供者:
weixin_42121725
AGR2介导的肺腺癌转移新机制网络通过抑制与干扰素偶联的细胞骨架与类固醇代谢依赖的体液免疫React
通过与358 GRNInfer和19 Pearson(AGR2 CC -0.25)的17个重叠分子,在肺腺癌中与人正常相邻组织相比,构建了7个前梯度同源物2(AGR2)抑制的不同分子相互正相关网络。 基于GO,KEGG,GenMAPP,BioCarta和疾病数据库,我们通过抑制MAST1的细胞骨架确定了AGR2介导的肺腺癌转移。 SOAT2的类固醇代谢; POU2AF1的体液免疫React; IFI6的α干扰素诱导型; IGKC_3,CTA_246H3.1的免疫球蛋白。 因此,我们提出了AGR2
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:4194304
提供者:
weixin_38733787
低糖转运蛋白SLC2A5抑制人正常邻近肺腺癌细胞质原B细胞发育机制的网络
溶质载体家族2(促进的葡萄糖/果糖转运蛋白)成员5(SLC2A5)抑制了七个不同的分子Pearson互相关网络,这些网络由368 GRNInfer和34 Pearson的24个重叠分子在低水平人类正常邻近环境中在SLC2A5 CC B-0.25下构建将组织与高肺腺癌进行比较。 基于GO,KEGG,Gen-MAPP,BioCarta和疾病数据库,我们的结果表明,低SLC2A5抑制网络包括AP1M2_1的高尔基体; CUL7,SAC3D1的细胞周期; STYXL1的蛋白质氨基酸去磷酸化; SOX4_
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:1048576
提供者:
weixin_38705558
iqKM:iqKM是用于KEGG模块识别和定量的易于使用的管道-源码
iqKM(KEGG模块的识别和量化) iqKM是易于使用的管道,用于分配和/或量化元基因组/基因组中的KEGG正交(KO)和KEGG模块(KM)。 iqKM -i genome.fna -o out_dir --help_dir help_dir iqKM -i metagenome.fna -o out_dir --help_dir help_dir --fq raw_reads.fastq(.gz) --meta --quantify iqKM -h 详细的管道演练 安装 iqKM是为L
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-09
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42118701
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