PMRC:基于路径图的多重读取集聚类和压缩
PMRC是一种用于压缩多个FASTQ文件的新颖聚类方法,该方法基于每个文件中最小化器的频率来构造特征空间,并根据路径图将文件分为子组。
下载并安装
git clone gitgithub.com:ttan6729/PMRC.git
cd MRC
sh install.sh
用法
用法:压缩-压缩FASTQ数据集。 输出写入'* .PMRC'文件
./PMRC.sh -a m -r test.txt (compress with minicom, fil