体细胞短V 按照，该存储库中的脚本从BAM文件中调用了体细胞短变体（SNP和indel）。已对工作流和脚本进行了专门优化，以在Gadi国家计算基础架构上高效且大规模地运行。 设置 GRCh38 / hg38 + ALT重叠群 Somatic-ShortV管道与管道无缝。脚本使用相对路径，因此正确的设置很重要。 完成后： 转到创建最终bams的工作目录。 确保您有一个.config文件，该文件是制表符分隔的文件，其中包含#SampleID LabSampleID SeqCentre Libra