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搜索资源列表

  1. Python递归解析Json文件

  2. 使用Python递归解析从TCGA下载的metadata.cart.json文件

  3. 所属分类：Python

    • 发布日期：2017-12-12
    • 文件大小：6144
    • 提供者：csanmum

  1. miRNA数据分享便于使用与学习

  2. 一种来与于TCGA数据库的miRNA数据分享，便于使用与学习

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2018-03-21
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：u013365071

  1. 下载TCGA工具

  2. 下载TCGA数据用，这个优点我觉得在于下载数据的实时性有保证，并且它也是从官网下载的，最主要它支持断点下载。。。就算你网再不稳定。。睡一觉总能下好了

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2018-03-26
    • 文件大小：7340032
    • 提供者：qq_37327056

  1. TCGA简易下载工具

  2. 该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤，合并TCGA数据库中下载的文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2018-08-31
    • 文件大小：14680064
    • 提供者：qq_43103379

  1. 结直肠癌TCGA+GEO数据库临床资料

  2. 结直肠癌TCGA+GEO数据库临床资料 实时更新TCGA和GEO中结直肠癌的数据

  3. 所属分类：算法与数据结构

    • 发布日期：2018-10-18
    • 文件大小：542720
    • 提供者：weixin_43455587

  1. tcga官方下载工具

  2. tcga官方下载工具 最近服务器不稳定 有时候下载很慢 如果很难下载可以试试从这里下载

  3. 所属分类：数据库

    • 发布日期：2018-11-04
    • 文件大小：15728640
    • 提供者：weixin_43602418

  1. TCGA临床数据提取

  2. 自己编写程序，对TCGA的临床信息进行整理和提取，便于做生存分析

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2019-04-12
    • 文件大小：175104
    • 提供者：qq_19338891

  1. TCGA的RNA-seq数据id转换

  2. TCGA 的 RNA-seq 文件的 gene id 是 ENSEMBL 的 RNA id，使用的时候常常需要转化成 gene symbol。此文档介绍了id转换的方法

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2019-04-12
    • 文件大小：414720
    • 提供者：qq_19338891

  1. 原癌基因AEG-1 通过上调MMP-9促进食管鳞癌的侵袭

  2. 原癌基因AEG-1 通过上调MMP-9促进食管鳞癌的侵袭，吴阁艳，朱金容，[目的]探讨原癌基因星形细胞上调基因-1（AEG-1）在食管鳞癌中的生物学功能及机制。[方法]分析癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）公共数据库中

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-21
    • 文件大小：527360
    • 提供者：weixin_38689477

  1. msvcr100.dll

  2. MSVCR100.dll文件的下载，把MSVCR100.dll文件放入TCGA小工具安装路径下，重新启动就可以使用TCGA小工具了。

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2020-01-17
    • 文件大小：781312
    • 提供者：weixin_41869644

  1. 癌症CT影像数据【Kaggle数据】.txt

  2. 本数据集是一个癌症CT图像数据，包括69位不同的患者的475个病例的中等规模的CT影像和患者年龄。该数据是 TCGA-LUAD 肺癌CT影像数据库的一部分。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-05
    • 文件大小：53
    • 提供者：a15570741002

  1. 差异分析韦恩图

  2. 利用R语言找出差异基因并作韦恩图，数据是从TCGA上获得的

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2019-03-17
    • 文件大小：2048
    • 提供者：maqingzhi128

  1. TCGA-KICH 癌症 CT 影像.torrent

  2. TCGA – KICH 癌症 CT 影像是腺瘤和腺癌相关的数据集，其包含来自 113 人共 2325 个数据文件，该数据集旨在对癌症诊治过程进行全程数字化跟踪，并以数字档案的形式记录检查结果、处方和疗效。 该数据集由 GDC Data Portal 发布。

  3. 所属分类：互联网

    • 发布日期：2020-06-20
    • 文件大小：17408
    • 提供者：a15570741002

  1. 块约束鲁棒主成分分析及其在TCGA数据综合分析中的应用

  2. 块约束鲁棒主成分分析及其在TCGA数据综合分析中的应用

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-24
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_38665162

  1. cancer_data_granularity:TCGA和CEDCD中的人口类别-源码

  2. cancer_data_granularity:TCGA和CEDCD中的人口类别

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-18
    • 文件大小：550912
    • 提供者：weixin_42160376

  1. panclassif:一种提高TCGA癌分类器性能的方法-源码

  2. PanClassif：用于癌癌分类的机器学习分类器管道 这是一个完整的机器学习管道软件包，可用于TCGA癌症RNA-seq基因计数数据。 数据预购 使用TCGA2STAT下载TCGA癌症和正常样本 使用knn-smoothing对上述收集的数据进行平滑处理（ ） 功能 featSelect（homepath，cancerpath，normalpath，k） 参量 homepath：（str）您要保存所有生成的文件和文件夹的路径。 癌变路径：（str） 所有癌症的癌症基因表达矩阵所处的路径。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：204800
    • 提供者：weixin_42110038

  1. TCGA-肺癌数据分析：来自TCGA数据集的肺癌数据分析项目-源码

  2. TCGA肺癌数据分析 该数据分析项目已在密歇根大学的2020年秋季我的Stats 600回归分析课程中完成。 分析的数据包含肺癌患者的样本以及不同的临床因素及其基因组信息。 在此分析中，我想回答以下问题：哪些mRNA基因表达与肺癌患者的生存时间最相关？ 与其他种族，性别和年龄等临床因素相比，吸烟与肺癌患者的生存时间是否更紧密相关？ 放射疗法是延长患者生存时间的有效手段吗？

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：229376
    • 提供者：weixin_42099070

  1. curatedTCGAData：来自癌症基因组图谱（TCGA）的经过筛选的数据作为MultiAssayExperiment对象-源码

  2. 策划TCGAData 总览 curatedTCGAData是Bioconductor发行版和开发版中的实验数据包。 它利用ExperimentHub从吨他Çancerģenome甲TLAS（TCGA）作为对象MultiAssayExperiment预处理访问和策划数据。 临床治疗 来自TCGA的临床数据集包括许多变量，包括人口统计学和病理学变量。 进行了整理以合并其他一级数据和子类型信息。 删除了所有空变量，并将它们的名称保存在colData元数据中。 正在进行的工作包括合并colData不同级

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-10
    • 文件大小：179200
    • 提供者：weixin_42143161

  1. Shiny_tcga_tsne：tSNE框架，用于TCGA和其他大型患者数据集的可视化和分析-源码

  2. Shiny_tcga_tsne：tSNE框架，用于TCGA和其他大型患者数据集的可视化和分析

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-10
    • 文件大小：407552
    • 提供者：weixin_42160398

  1. TCGA数据下载及全流程分析（更新中）

  2. 一、GDCRNATools包下载 首先下载R包 if (!requireNamespace(BiocManager, quietly = TRUE)) install.packages(BiocManager) BiocManager::install(GDCRNATools) 下载好之后运行，以COAD数据为例，下载： library(GDCRNATools) gdcRNADownload(project.id = TCGA-COADREAD, data.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-20
    • 文件大小：25600
    • 提供者：weixin_38704786
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