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  1. TED:消除肿瘤微环境卷积的完全贝叶斯方法-源码

  2. TED(现称为BayesPrism) 使用统计边际化(BayesPrism)推断贝叶斯细胞比例重建:肿瘤微环境组成和基因表达的完全贝叶斯推断。 BayesPrism由反卷积模块和嵌入学习模块组成。去卷积模块利用来自scRNA-seq的细胞类型特异性表达谱,并实施完全贝叶斯推断,以根据肿瘤样品的大量RNA-seq表达共同估算细胞类型组成和细胞类型特异性基因表达的后验分布。嵌入学习模块使用期望最大化(EM)来使用肿瘤途径的线性组合来近似肿瘤表达,同时以反卷积模块估算的非肿瘤细胞的表达和分数为条件。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-18
    • 文件大小:61865984
    • 提供者:weixin_42104906