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MDAnalysis
MDAnalysis 分析分子动力学轨迹 MDAnalysis-0.7.2.tar.gz MDAnalysis is an object-oriented python toolkit to analyze molecular dynamics trajectories generated by CHARMM, Gromacs, NAMD, LAMMPS, or Amber. It allows one to read molecular dynamics trajectories and a
所属分类:
医疗
发布日期:2011-05-07
文件大小:18874368
提供者:
kamo54
分子动力学软件amber的权威网上教程pdf版
amber workshop tutorial(适用版本8-9) 分子动力学模拟软件amber的一个比较官方的教程,非常辛苦的从网上把一个个页面download下来后整理生成为pdf文件,感兴趣的童鞋可以拿去打印出来看,比在线一边看一边操作要省力。同时作为资料保存也不错。
所属分类:
软件测试
发布日期:2011-06-22
文件大小:9437184
提供者:
xianyuanshan
CUDA+by+Example
计算行业正在从只使用CPU的“中央处理”向CPU与GPU并用的“协同处理”发展。为打造这一全新的计算典范,NVIDIA®(英伟达™)发明了CUDA并行计算架构,该架构现已应用于GeForce®(精视™)、ION™(翼扬™)、Quadro以及Tesla GPU(图形处理器)上,对应用程序开发人员来说,这是一个巨大的市场。 在消费级市场上,几乎每一款重要的消费级视频应用程序都已经使用CUDA加速或很快将会利用CUDA来加速,其中不乏Elemental Technologies公司、
所属分类:
C/C++
发布日期:2011-12-27
文件大小:4194304
提供者:
xxt030626
NAMD入门教程
1. 分子动力学模拟概论 1.1 分子动力学模拟的发展 1.2 分子动力学模拟的基本原理 1.3 分子动力学模拟相关软件 2. 分子动力学入门 2.1 基本设置 2.2 生成蛋白质结构文件(PSF) 2.3 蛋白质的溶质化 2.4 球状水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟 2.5 立方水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟 2.6 简单的结果分析 3. 分析方法 3.1 平衡态分子动力学模拟分析 3.1.1 每个残基的RMSD值 3.1.2 麦克斯韦-波尔兹曼(Maxwe
所属分类:
专业指导
发布日期:2013-05-14
文件大小:1048576
提供者:
u010696678
AMber模拟实例
Amber是一款优秀的分子模拟软件,这里提供了一个实例。
所属分类:
专业指导
发布日期:2014-02-05
文件大小:228352
提供者:
u013597450
ambertool手册
分子动力学软件包amber辅助工具ambertool手册,非常棒
所属分类:
专业指导
发布日期:2014-10-13
文件大小:9437184
提供者:
qq_21040959
amber分子动力学软件安装方法
在安装amber软件的过程中,所遇到的各种问题,及其最终的解决方法。
所属分类:
群集服务
发布日期:2015-12-24
文件大小:16384
提供者:
syd89522
Amber Tools 19.txt
Amber Tools一直下不动,分享给大家吧~ Amber是由加利福尼亚大学的Peter Kollman教授是专门针对生物分子系统模拟而开发的分子动力学应用程序。 软件组成: 包含两部分,AmberTools18和Amber18,二者无相互依赖关系。 AmberTool以源代码的形式分发,需要编译才可以使用。
所属分类:
医疗
发布日期:2020-03-01
文件大小:68
提供者:
Movice
2-甲基环己醇在HIV-1蛋白酶表面附着位点的模拟研究
2-甲基环己醇在HIV-1蛋白酶表面附着位点的模拟研究,王加磊,孟现美,本研究采用Amber ff12SB力场对HIV-1蛋白酶活性位抑制剂体系和异位抑制剂体系分别进行了200纳秒的分子动力学模拟,发现了2-甲基环己醇除Exo�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-07
文件大小:1048576
提供者:
weixin_38693528
amber 分子动力学
amber 分子动力学关于金属的,包括金属的处理以及金属动力学教程-总结,可以作为入门指导,
所属分类:
讲义
发布日期:2019-01-12
文件大小:2048
提供者:
weixin_44505287
amber分子动力学步骤
amber分子动力学步骤 挺好的 看看吧 挺有用的
所属分类:
专业指导
发布日期:2011-12-30
文件大小:9437184
提供者:
sfwere1
2018 Amber Reference Manual
Amber18分子动力学软件官方用户手册
所属分类:
讲义
发布日期:2020-12-28
文件大小:9437184
提供者:
D2472260125
cp2k:量子化学和固态物理学软件包-源码
CP2K CP2K是一个量子化学和固态物理软件包,可以对固态,液态,分子,周期性,材料,晶体和生物系统进行原子模拟。 CP2K为不同的建模方法(例如使用混合高斯的DFT和平面波逼近GPW和GAPW)提供了通用框架。 支持的理论水平包括DFTB,LDA,GGA,MP2,RPA,半经验方法(AM1,PM3,PM6,RM1,MNDO等)和经典力场(AMBER,CHARMM等)。 CP2K可以使用NEB或二聚体方法进行分子动力学,元动力学,蒙特卡洛,埃伦菲斯特动力学,振动分析,核心能级谱,能量最小化和
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-25
文件大小:94371840
提供者:
weixin_42146086