evoKGsim SS ：分类语义相似性； ES ：嵌入语义相似度； SSM ：语义相似性度量； GP ：遗传编程； GO ：基因本体论； PPI ：蛋白质-蛋白质相互作用。 先决条件 安装python 3.6.8; 安装Java JDK 11.0.4; 通过运行以下命令来安装python库： pip install -r req.txt 。 1.基准数据集 为了使程序正常工作，请提供一个包含蛋白质对和相应标签（相互作用或非相互作用）的文本文件。 制表符分隔的文本文件有3列： 第一栏-P