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nextflow:用于数据驱动的计算管道的DSL-源码
“数据流变量在并发编程中表现出色” 快速概述 Nextflow是一个生物信息学工作流管理器,可用于开发可移植和可复制的工作流。 它支持在各种执行平台上部署工作流,包括本地,HPC调度程序,AWS Batch,Google Cloud Life Sciences和Kubernetes。 此外,它通过对Conda,Docker,Singularity和模块的内置支持,提供了对管理工作流依赖性的支持。 内容 基本原理 随着大数据的兴起,对大型数据集进行分析和运行实验的技术变得越来越必要。 并行化和分
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-30
文件大小:8388608
提供者:
weixin_42121905
workflows-nextflow:使用Nextflow和nf-core进行工作流管理-源码
本课是Nextflow和nf-core的简介。 使用诸如Docker和Singularity之类的软件容器来实现可扩展且可重现的科学工作流程。 它允许改编以最常见的脚本语言(例如R和Python)编写的管道。 它具有一种特定于域的语言(DSL),可简化在云和群集上复杂的并行和响应式工作流的实施和部署。 本课还将介绍 :一个框架,该框架提供了一个社区驱动的,经过同行评审的平台,用于开发用Nextflow编写的最佳实践分析管道。 本课鼓励使用Nextflow和nf-core作为开发工具来构建和
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-31
文件大小:732160
提供者:
weixin_42142062