Babraham Nextflow管道 介绍 该存储库包含用于大量处理NGS数据的nextflow管道。 这些管道旨在在我们集群的环境中工作，但可以很容易地使其在其他地方工作。 这些管道使运行大量序列的标准处理变得容易。 它们通常分为以下两种类型之一： 用于完整处理特定类型数据（例如nf_rnaseq ）的nf_rnaseq ，它将运行多个链接的程序 运行单个程序的管道（例如nf_fastq_screen ），在需要更有限的处理时很有用 所有管道均设计为可直接执行，并且其中许多管道只需要提供