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python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例
主要介绍了python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
所属分类:
其它
发布日期:2020-09-16
文件大小:54272
提供者:
weixin_38680957
python 读取.nii格式图像实例
主要介绍了python 读取.nii格式图像实例,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
所属分类:
其它
发布日期:2020-09-16
文件大小:66560
提供者:
weixin_38556189
python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例
nii.gz格式是医学图像常用的压缩格式,python中可用nibabel和sitk来读取保存。 使用nibabel 由于使用nibabel图像会旋转90度,所以读取保存的时候还得保存映射信息,3维图像格式为(z, y, x) 读取nii.gz文件 img = nib.load('xxxxx.nii.gz') img_affine = img.affine img = img.get_data() 保存nii.gz文件 nib.Nifti1Image(img,img_affine).to_f
所属分类:
其它
发布日期:2020-12-17
文件大小:56320
提供者:
weixin_38733333
python 读取NIFTI(.nii)格式图像
1.NIFTI格式图像图像来源 很有必要自己浏览这个网址,详细介绍了NIFTI的细节 有助于代码理解的点做以下总结: nifti格式存储的数据使用了一对文件**.hdr/.img** nifti格式中,前三个维度以定义三个空间维度-x,-y和-z,第四个维度定义时间点-t。其余维度(五到七)用于其他用途。比如,第五维可以存一些预定义的用途,例如存储体素特定的分布参数或保存基于矢量的数据。 2.NiBabel包 NiBabel包是可以对常见的医学和神经影像文件格式进行读写 import matpl
所属分类:
其它
发布日期:2020-12-22
文件大小:251904
提供者:
weixin_38620099
Ubuntu+python将nii图像保存成png格式
这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。 这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法: https://www.jb51.net/article/165692.htm 系统:Ubuntu 16.04 软件: python 3.5 先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。 import nibabel as nib import numpy as np import imageio import os def read_niifile(niifile):
所属分类:
其它
发布日期:2020-12-31
文件大小:34816
提供者:
weixin_38522323
python 读取.nii格式图像实例
我就废话不多说了,大家还是直接看代码吧~ # encoding=utf8 ''' 查看和显示nii文件 ''' import matplotlib matplotlib.use('TkAgg') from matplotlib import pylab as plt import nibabel as nib from nibabel import nifti1 from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D example_filename = '../A
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-21
文件大小:67584
提供者:
weixin_38616139
python实现批量nii文件转换为png图像
之前介绍过单个nii文件转换成png图像: https://www.jb51.net/article/165693.htm 这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。 import numpy as np import os #遍历文件夹 import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包 import imageio #转换成图像 def nii_to_image(niifile): filen
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-20
文件大小:40960
提供者:
weixin_38682406