R包'ratematrix' Daniel S.Caetano和Luke J.Harmon 描述 R包，用于使用系统进化树研究两个或多个性状之间的进化相关性模式。 'ratematrix'提供了一套工具，用于估计进化率矩阵（R），并使用马尔可夫链蒙特卡洛方法以后验分布的形式结合不确定性。 有关此处实施的模型的种类以及它们的经验和模拟数据的更多信息，请参阅我们在系统生物学上发表的文章：“ Caetano，DS和LJHarmon。2019年。不确定性估计相关性状进化的速率。系统传记68：412–