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搜索资源 - scShapes:用于建模和识别单细胞RNA测序数据中差异分布的统计框架-源码
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scShapes:用于建模和识别单细胞RNA测序数据中差异分布的统计框架-源码
scShapes 我们提出了一种新的统计框架,用于通过使用广义线性模型(GLM)对基因表达读取计数进行建模,从而确定治疗条件之间单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的差异分布。 我们使用对数链接函数和基于模型的差异归一化,在每种治疗条件下使用误差分布泊松(P),负二项式(NB),零膨胀泊松(ZIP)和零膨胀负二项式(ZINB)独立地对每个基因建模在测序深度上。 由于我们框架中考虑的所有四个分布都属于同一分布家族,因此我们首先执行Kolmogorov-Smirnov(KS)测试以选择属于
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:29696
提供者:
weixin_42102401