Freemarker页面语法 A 概念 最常用的 3 个概念 sequence 序列,对应java 里的list 、数组等非键值对的集合 hash 键值对的集合 namespace 对一个ftl 文件的引用, 利用这个名字可以访问到该ftl 文件的资源 B 指令 if, else, elseif 语法 Java代码 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 用例 Freemarker代码 x is 1 x is 1 x is n
bio_seq
一个用于将核苷酸编码为IUPAC模糊度代码以及写入和读取FASTA文件的库。
基于的核苷酸的8位无符号整数表示形式
对齐解析
对于解析对齐,要求所有FASTA条目都具有相同的长度,否则将引发错误。
解析对齐字符串
import bio_seq
let s = ">header1 \n ACTG \n >header2 \n >CTUG"
let r = parseFastaAlignmentString (s)
解析对齐文件
import nim_seq
l