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simpleSCENIC:我发现该小插图繁琐且包含过时的命令。 这是sc-impler版本-源码
简单的代码即可在单个单元格数据上运行SCENIC 单细胞测序实验的基本优点是探索生物样品的异质性。 如果您关注的是单一组织类型,这会特别有趣(我认为),因为它正在发生变化。这可能是发育中的组织中的细胞,培养物中的细胞或疾病过程中的细胞(可能与正常组织相比) 当您执行上述操作时,scRNAsq本质上向您显示了组织的各种转录状态。 样本中存在多少个状态是一个棘手的问题,并且围绕某种类型的中心围绕样本的实际多样性,结合的聚类分辨率以及您对每个注释为单独的状态/类型的信心有多强就是这样 一旦确定了这
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:7168
提供者:
weixin_42097508