SiteGA-结合位点的遗传算法识别。 描述 当前的SiteGA版本（Levitsky等人，正在准备中）代表了的算法 在ChIP-seq数据集中用于从头进行基序搜索。 SiteGA是一种随机算法，可在输入序列中搜索相互依赖的局部定位的二核苷酸（LPD）的模式，该模式可模拟转录因子结合位点内核苷酸环境的近距离和远距离吸引。 因此，SiteGA方法与传统的位置权重矩阵（PWM）完全不同，传统的位置权重矩阵（PWM）根据来自各个位点位置的核苷酸频率的累加影响来搜索最保守的基序。 要求 SiteGA源代